15 dicembre 2012

Nucleotidi e nucleosidi: nomenclatura



Mi ha scritto Giulia: voleva sapere la differenza tra nucleotidi e nucleosidi.
La risposta la trovate in questo post: nucleotidi e nucleosidi
Oggi voglio entrare un po' più nel dettaglio nella loro nomenclatura con l'aiuto di due semplici tabelle:

Nucleoside: base azotata + ribosio/deossiribosio
base azotata
ribonucleoside

deossiribonucleoside

adenina
adenosina
deossiadenosina

guanina
guanosina
deossiguanosina

uracile
uridina
deossiuridina

timina
timidina
deossitimidina

citosina
citidina
deossicitidina




Nucleotide: base azotata + ribosio/deossiribosio 
+ 1,  2 o 3 gruppi fosfato
ribonucleotide

deossiribonucleotide
adenosina monofosfato (AMP)
adenosina difosfato (ADP)
adenosina trifosfato (ATP)
deossiadenosina monofosfato (dAMP)
deossiadenosina difosfato (dADP)
deossiadenosina trifosfato (dATP)
guanosina monofosfato (GMP)
guanosina difosfato (GDP)
guanosina trifosfato (GTP)
deossiguanosina monofosfato (dGMP)
deossiguanosina difosfato (dGDP)
deossiguanosina trifosfato (dGTP)
uridina monofosfato (UMP)
uridina difosfato (UDP)
uridina trifosfato (UTP)
deossiuridina monofosfato (dUMP)
deossiuridina difosfato (dUDP)
deossiuridina trifosfato (dUTP)
timidina monofosfato (TMP)
timidina difosfato (TDP)
timidina trifosfato (TTP)
deossitimidina monofosfato (dTMP)
deossitimidina difosfato (dTDP)
deossitimidina trifosfato (dTTP)
citidina monofosfato (CMP)
citidina difosfato (CDP)
citidina trifosfato (CTP)
deossicitidina monofosfato (dCMP)
deossicitidina difosfato (dCDP)
deossicitidina trifosfato (dCTP)


Ecco fatto!
Spero che queste tabelle aiutino a non fare confusione tra: basi azotate, nucleotidi e nucleosidi.
Vi eravate mai accorti che erano così tanti? Come? Pensavate che erano solo 4, come le basi azotate?!
Grazie a Giulia che mi ha dato lo spunto per questi utili post ;-)
Tania Tanfoglio

8 commenti:

  1. Grazie per il post (:
    Non riesco a capire se ho capito veramente..scusi per il gioco di parole.. :D
    Casomai ritornerò quando avrò la mente più libera!

    RispondiElimina
    Risposte
    1. La GUANINA è semplicemente una BASE AZOTATA.
      La GUANOSINA, invece,è formata dalla base azotata guanina e dallo zucchero pentoso: è un NUCLEOSIDE. Precisamente è un ribonucleoside. Se vogliamo riferirci al corrispondente deossiribonucleoside è corretto utilizzare il termine deossiguanosina.
      I corrispondenti nucleotidi sono formati dalla base azotata guanina, dallo zucchero pentoso e dal gruppo fosfato (i gruppi fosfato possono essere 1, 2 oppure 3).
      Naturalmente, anche in questo caso, dobbiamo distinguere:
      ribonucleotide può essere:
      guanosina monofosfato (GMP)
      guanosina difosfato (GDP)
      guanosina trifosfato (GTP)

      deossiribonucleotide può essere:
      deossiguanosina monofosfato (dGMP)
      deossiguanosina difosfato (dGDP)
      deossiguanosina trifosfato (dGTP)

      Lo stesso discorso vale per tutti gli altri! ;-) Che ne dici?!

      Elimina
  2. Questa volta penso di aver capito! (:
    Comunque me ne accorgerò quando in biochimica dovrò scrivere la struttura dell'ATP..;-)
    Grazie mille!

    RispondiElimina
    Risposte
    1. ATP che è un ribonucleotide :-) In bocca al lupo!
      Ciao,
      Tania

      Elimina
  3. Grazie per le utilissime tabelle :)
    Vorrei porti una domanda: il deossitimidilato monofosfato è un nome equivalente della deossitimidina monofosfato?

    RispondiElimina
    Risposte
    1. Mi fa piacere! Si, sono equivalenti!
      Un saluto,
      Tania

      Elimina
    2. Ma la timidina esiste? Cioè come struttura ma non nell'organismo giusto?

      Elimina
    3. Ciao Anonimo,
      Benvenuto!
      Prima di tutto una precisazione. Spesso, quando si parla di timidina ci si riferisce alla deossitimidina. Quest'ultima è un nucleoside formato da uno zucchero pentoso e dalla timina; è presente in tutti gli organismi viventi: costituisce il 25% circa del DNA. Nell'RNA non è presente la timidina; al suo posto viene utilizzata l'uridina. Nell'organismo trovi la timidina monosfoato (TMP): è un intermedio metabolico per la biosintesi del DNA, viene convertita in desossi-trifosfata (dTTP), pronta per entrare nella struttura del DNA.
      Spero di aver chiarito il tuo dubbio,
      Ciao,
      Tania

      Elimina

placeholder
placeholder